新疆昌吉回族自治州中医医院是一家集治疗、预防保健、科研、教学、养生、治未病、康复及中医文化传播为一体三级甲等中医医院，编制442个，职工1044人。编制床位880张，临床科室32个，医技科室13个，行政职能后勤科室17个。国家级重点专科2个、自治区级重点专科6个、开展针灸、推拿等特色中医诊疗技术72种，研发院内中药制剂18种，特色中药膏方40余种。建立三部六病学术流派新疆工作站、胡希恕经方医学新疆传承基地，“北京世针联中医微创水针刀筋骨针吴汉卿”工作室、“韦以宗”名医工作室和整脊培训基地，牵头成立昌吉州康复、针灸、胸痛中心等专科联盟，带动昌吉州中医药事业发展。近年来州级以上课题62项，获国家专利7项，荣获全国中医药科技推广工作先进集体、自治区级“文明单位”，“平安医院”等荣誉称号。